暑期大學生夏令營訓練心得體會(武漢大學)
快要離開NIBS了,心中確實不舍。這短短一個多月對我的影響很大,仿佛有種打開了新世界大門的感覺,盡管新世界并不一定與想象一致。所以,如果說我有什么感想的話,最多的應該是感恩吧。
我最感激的是實驗室的老師與師兄師姐。來NIBS的第一天,黃牛老師不僅饒有興致地聽完了我對課題的設想,而且還特別根據我想做的東西,安排了曾經做過類似課題的孫漢資師兄帶我。接下來的日子里,我在師兄師姐的幫助下學會了如何使用Gromacs、Amber兩種分子動力學模擬軟件,學會了進行MD、SMD、Umbrella Sampling以及MM-PBSA分析,并使用gnuplot、VMD、Chimera等工具來畫圖、分析結果數據等。最終也就我感興趣的chaperone蛋白-核酸相互作用,特別是其中的熵傳遞,做了些許工作。雖然這些工作并不能算得上嚴格的科學研究,畢竟一個月時間太短,而計算領域的結果需要在研究者完全熟悉軟件原理、參數等的情況下才具有可信度,但是這個過程中學到的、感悟到的東西才是真正重要的。
正如所有的科研工作都不是一蹴而就的,學習的過程也是。
一開始,漢資師兄打算讓我先掌握MD的基本流程,于是安排我就著Gromacs的tutorials來一步步把跑simulation的步驟給過一遍。緊接著,漢資師兄很nice地跟我討論了我想做的課題,提出Umbrella Sampling也許能夠提供蛋白-核酸相互作用這個秒級過程的信息,于是我也開始就這部分進行學習。這整個過程并不簡單,因為,我在此前基本沒有接觸過Linu*系統(tǒng),編程語言也只學習過最基礎的C,R語言也僅僅是自學過一段時間。但是要運行Gromacs首先要學會基本的Linu*系統(tǒng)操作,而其中的幾個關鍵步驟更是需要對Python、Perl等語言有基本的理解。因此一開始我就陷入了一個困境,無論是對Linu*系統(tǒng)的完全掌握還是對Python、Perl腳本編程的掌握,任何一個都需要花費1個月以上的時間。此時,實驗室的其他學長給了我個很好的建議:即學即用。先想好你要做的是什么,然后Google一下,立即依樣畫葫蘆解決問題。可以說,沒有這個思想的啟發(fā),我無法在這短短一個月時間內高效地學到這么多東西。然而,猶如Perl跟Python語言編程這種難度的內容,確實沒辦法很快掌握,我也在需要用到這些內容的地方stuck了2-3天。這時,漢資師兄給了我個很好的建議,如果這些Perl、Python腳本解決的問題并不是那么復雜,為什么不用相對簡單的Shell腳本替代它呢?于是,我花了2天左右研究如何進行Shell腳本編程,后來也在不斷使用中練習這種編程方式,最終不僅可以用Shell替代部分的原腳本,也使后來的各種工作的速度顯著提升。
然而,當我掌握了在Gromacs中跑MD與Umbrella Sampling后,我意識到,它們都只是拿到結果的方式,如何對結果進行分析才是我下一步要解決的問題。與漢資師兄討論后,他告訴我,熵并不是計算中值得關注的值,因為它對體系、算法等太敏感,而且較難通過實驗直接測得,所以難以印證。但是他仍然給我指了一條路--Amber的MM-PBSA分析,并鼓勵我不要放棄自己的想法,說不定PhD時還能再試(2333333)。后面我就在折騰Amber的MM-PBSA分析的同時研究如何搭建自己的體系了。首先我選取的典型chaperone之一的NC具有兩個鋅指結構域,而力場設定的作用力并不足以模擬并穩(wěn)定天然的鋅指狀態(tài),因而必須對8個配位鍵施加restraint。加之restraint的施加在Gromacs與Amber中的方式是不同的,所以我花了幾天時間在這上面。另外,由于NC是個小蛋白,PDB中NC-ssDNA復合物的結構是由NMR得到的,這種結構文件常具有多個Model,因此需要另外寫腳本予以拆分。克服了這些困難之后,我一方面參考官方網站上的指導與說明以及其他參考文獻的記載來設置參數,另一方面向其他學長學姐請教經驗,不斷地設置更優(yōu)的參數、換用更穩(wěn)定的版本、debugging,終于做成了一些東西。
其實我想感謝的還有很多,包括在組會上進行指導的黃牛老師,讓我明白了如何更好地進行學術演講、如何開始一個研究并在遇到困難時想其他方法克服,也讓我了解了這個領域、見識了生物學、藥學、計算科學、有機化學等學科相互交織的神奇;包括在年會上發(fā)表了精彩演講的各位老師,讓我領略了什么是好的科研、什么是開創(chuàng)式的新思路,也讓我知道了各領域的前沿狀態(tài);包括其他summer students,陪伴我度過了這愉快的一個月,跟我探討科學問題,也讓我看到了自己某些方面的不足......
真心感激在NIBS這段美好的歲月,它將常伴我心,溫暖、照亮我今后踏足科研的道路。
篇2:中學生考古夏令營心得感想
中學生考古夏令營心得感想
今天下午,我們去了第一個與考古關系不是特別大的景點--杭州西湖及雷峰塔,感觸頗多。
說說關于杭州西湖的問題。這次游覽西湖的經歷,遠沒有宣傳中、印象中的西湖美好。個人認為,西湖正是國內旅游景點與文化遺產過度商業(yè)化,所帶來的弊病的集中體現。下面以西湖為例試著分析一下存在的問題及解決方案。
一,過度開發(fā)帶來愈趨嚴重的環(huán)境污染與生態(tài)破壞。杭州西湖近年來的水質富營養(yǎng)化情況不容樂觀,甚至“杭州之腎”--西溪濕地的環(huán)境也受到了影響。而各地的旅游景點均不同程度地存在此問題。
二,游客的游覽幸福感與興致大受影響。一方面,人口密度劇增間接改變了氣候與環(huán)境,致使游客體驗舒適感下降(盡管有時這種下降由于個人無法對比氣候環(huán)境的變化而顯得隱秘)。以西湖為例,摩肩接踵的人群使得湖泊水體的減緩升溫速度功能受損。漫步蘇堤時,我們個個汗流浹背衣襟全濕。另一方面,人群過密及沿途的林林種種的商鋪,飯館等輔助設施令游客難以體味一個人游賞的閑情逸致。原先文學作品中西湖游覽時的浪漫情趣早已煙消云散,取而代之的是行人躲閃著觀光車的無奈、忍受著此起彼伏的噪音的心酸、注視著價高質劣千篇一律商品遮擋了湖光山色的憂郁……
三,破壞了風景名勝的文化內在價值,對于傳承和弘揚民族文化不利。如今許多風景名勝的古代傳統(tǒng)特色蕩然無存,勢必影響游客對文化的理解,而這種受商業(yè)化干擾而使舊有文化氣氛消失殆盡的現象,怎能便于傳承原先更有價值的文化內涵呢?
四,商業(yè)化過程中不注重保護與管理,使得景區(qū)產生諸如廁所臟亂差、商品價格虛高等問題,極大地影響了中國國際形象,也影響了國際客源的涌入。如此一來,不僅間接阻礙旅游業(yè)發(fā)展,深層上說更使中華文化的國際影響,口碑形象暗暗下降。諸多問題的根源,都是商業(yè)化過程中旅游人士目光短視,未將經濟利益與長遠文化效益結合。解決方法個人認為有二:加強、完善相關法制法制建設,尤其是懲罰措施要嚴厲;加強對文化傳承保護的教育宣傳工作。但仁者見仁,智者見智,還有待大家討論。
篇3:大學生參加暑假培訓活動的心得體會:夏令營感言
大學生參加暑假培訓活動的心得體會:夏令營感言
這個夏天我十分幸運地成為了NIBS的summer,充實地度過了在研究所的每一天。在這個國內乃至世界都堪稱一流的研究所里,我感到了前所未有的活力與力量。每當午夜12點從研究所的大門走出,遠遠的了望依然燈火通明的實驗室,心中那份對科學的崇敬油然而生。
科研篇
在來NIBS之前,我?guī)缀鯖]有任何的實驗背景,因此,從一開始進實驗室就能接觸到世界最先進的實驗儀器,從一開始就接受正規(guī)的實驗技能訓練,這對于我們這樣的實驗科學的人來說是一件無比幸福的事情。帶著滿腔的熱情我來到了NIBS,進入了實驗開始了科研生活。然而,科學只是一個看似神圣而又玄乎的詞語,而真正的工作卻仍然需要腳踏實地地實干。一開始預期的困難接踵而至,面對眾多陌生的儀器,一篇篇全英文的paper以及曾經在學校沒有訓練過的實驗技能都讓我無所適從。學了三年的本科化學,來到這樣的實驗室,還什么都不會,不免有一種挫敗感。最開始的幾周,我感覺每一天都是在惡補我的實驗知識,每一天都收獲頗多。隨著一點一滴的積累,我基本對實驗室也已經熟悉,對整個科研體系有了一定的認識,從一次做一個反應到一次做4個反應;從簡單的反應手忙腳亂到復雜的反應的從容應對;從看著師兄師姐過柱子,做核磁檢測反應到最后自己也能流利操作,這對我來說不能不說是一個飛躍。最值得一提的是lei lab做得很多的Tandem 3-Component Reaction ,這個反應要做到絕對的無水無氧,要用到t-BuLi這樣危險而sensitive的試劑,而且操作十分的繁瑣和復雜,被老板稱為是我們實驗室目前最復雜的反應。當我最開始被得知要做這個反應時是十分沒有自信的,也特別畏懼。因此,最開始做這個反應總是手忙腳亂,做得大汗淋漓。然而經過幾次的重復訓練,我終于能夠相對熟練地最好這個反應,讓我知道再難的事情也是一個熟能生巧的過程。
當然,每一天從早到晚的實驗是辛苦的,有時做了好幾天,重復了好幾次的反應卻最終換來失敗的結果。而且,在暑假這個大家都在放松休息的日子里,我又不是一個能特別專注的人,要我日復一日,從早到晚地把所有的時間和精力都投入到實驗中還是比較困難。或許我還不夠成熟,心中的那份想玩的心也一直在蠢蠢欲動。但是,在濃厚的科研氣氛下,我還是被深深的感染,都盡力去完成好自己的每一個實驗。
友情篇
這次夏令營的summer都是來自全國以及國外一些很知名的學府,在這六周的時間里,大家都在各自的實驗室里忙碌,沒有能夠把所有的人都認識是比較遺憾的事情。但是,我還是結識了一批朋友。特別是我們宿舍的另外六個summer,兩個北師大,中南大學,上海交大,山東大學,西安交大。雖然我們各自每天的實驗任務都很繁重,每天大家回到宿舍的時間也很晚而且不統(tǒng)一,但我們總喜歡每天晚上“天南海北”的臥談,無論是談論實驗室的各個PI,白天發(fā)生的趣事,還是大家一起暢談未來,交流出國的事情,這都是一種享受。我們宿舍7個,有5個考了G,大家是真正的志同道合,也希望我們在以后的日子中也能繼續(xù)保持聯(lián)系,相互交流思想。當然,這也不能不提及我們實驗室的兩個summer,跟他們相處的時間是最多的。也許是我們三個都很貪玩的原因,所以我們總是試圖尋找各種縫隙時間溜出研究所玩,每個周末我們都會去北京的一些景點,而且,連懶覺都不睡,從早玩到晚,充分利用難得的一天休息時間。當然,這并不代表我們不務正業(yè),我們在自己應該做事的時候還是認真的對待,不敢怠慢。就是在這樣時間的積累中,我們也結下了友誼。相識便是一種緣分,成為朋友更是難能可貴。這個夏天,我收獲了沉甸甸的友情。
感謝篇
首先應該感謝的是雷博,是他給我提供了這次難能可貴的機會。雖然他平時對我們要求嚴格,但是這些都是利于我們成長。同時他對科研兢兢業(yè)業(yè)的態(tài)度也成為了我努力的榜樣,雖然他還十分年輕,但他在我心中已經可以稱得上是一位杰出的科學家。感謝我?guī)熜掷畛谒哪托闹笇挛覐囊粋€實驗菜鳥變成了一個對實驗有相對認識和了解的人。感謝我實驗室的兩個summer,是他們給我?guī)砹酥T多快樂的因素。感謝王曉東所長,作為美國科學院院士,他與我們親切交談,沒有高人一等的架子,他告訴我們“科研不能功利化”,告訴我們做人的道理。感謝李學真老師和劉喜梅老師,感謝她們?yōu)槲覀僺ummer所做的一切。感謝NIBS,為我們提供了一流的科研環(huán)境,為我們提供了華麗的年會,為我們舉行專場燒烤晚會,請我們吃免費的大餐,一個星期給我們發(fā)150元的補助......要感謝的還有好多好多,謝謝二字已經不能完全表達我心中的感情。
短短的6周的夏令營,讓我結識了NIBS。以后不管我們去了哪兒,我們都可以自豪地說一聲:我們是NIBS人。的確,這份可貴的經歷將成為我一生的財富,埋藏在心的海底,每一次陽光灑進,都會激起陣陣暖流,帶給我永久的回味。